Banyaknya prestasi akademik maupun non akademik yang diperoleh Madrasah Ibtidaiyah Muhammadiyah (MIM) Karanganyar menghantarkan sekolah tersebut menjadi salah satu “Sekolah Unggulan” yang ditetapkan oleh Pimpinan Wilayah Muhammadiyah (PWM ) Jawa Tengah melalui Majelis Dikdasmen dengan penyerahan Sertifikat Sekolah Unggulan di Gedung Siti Walidah lantai 7 Kompleks Rektorat Universitas Muhammadiyah Surakarta (UMS). Selain MIM Karanganyar pada kesempatan tersebut juga diserahkan sertifikat Sekolah Unggulan PWM Jawa Tengah yang lain yaitu SD Muhammadiyah Plus Salatiga dan SMA Muhammadiyah 1 Wonosobo. Selamat selamat selamat.